26 июня 1941 года Даугавпилс был захвачен германской армией. Через несколько дней началось преследование евреев. Первым значительным местом уничтожения стал так называемый железнодорожный садик за городской тюрьмой.
15 июля 1941 года последовал приказ о том, что всё еврейское население в течение 10 дней должно переселиться в мостовое укрепление, где было создано гетто (сейчас — Даугавгривская тюрьма). По различным сведениям в гетто было согнано около 14 тысяч евреев. Это были жители Даугавпилса, беженцы из Литвы, а также евреи Краславы, Гривы, Вишек, Индры, Дагды, Илукстского уезда, а также других городов и местечек Латгалии. На 5 декабря 1941 года в гетто оставалось 962 человека, а через полгода, а именно 1 мая 1942 года при участии команды В.Арайса и местных полицейских было уничтожено почти 500 евреев. Осталось в живых 487 человек. Они были переведены в крепость, где работали в мастерских.
28 октября 1943 года оставших в живых узников отправили в Ригу в район Кайзервальда. А осенью последних узников Даугавпилсского гетто на пароходах доставили в Данциг (Польша), а затем распределили в различные лагеря: Берген – Бельзен, Штутгоф. Выжило примерно 100 евреев, часть из которых вернулась в Даугавпилс.
Рядом с местом, где когда-то было Даугавпилсское гетто, 6 сентября 2015 года, был открыт мемориальный камень памяти узников этого гетто.